Sisältöön
tampereen yliopisto: biolääketieteellisen teknologian yksikkö: tutkimus:
Biolääketieteellisen teknologian yksikköTampereen yliopistoBiolääketieteellisen teknologian yksikkö
Seppo Parkkila - Kudosbiologia

Tutkimuskohteet

Hiilihappoanhydraasitutkimus

Nykyiset tutkimuksemme päälinjat:

  • Tuottaa suuria määriä rekombinantti alfa- ja beta-hiilihappoanhydraaseja (CA) ja hiilihappoanhydraasien kaltaisia proteiineja (CARP) kinetiikka- ja rakennetutkimuksia varten
  • Tutkia CARP:ien toimintaa kudoksissa
  • Syöpäkasvaimiin yhdistettyjen CA isoentsyymien (CA II, CA VII, CA IX ja CA XII) tutkiminen

Tissue_Biology_2011.jpg
Kudosbiologian tutkimusryhmä 2011

Hiilihappoanhydraasit ovat entsyymejä, jotka kiihdyttävät hiilidioksidin ja veden välistä kaksisuuntaista reaktiota seuraavan kaavan mukaan: CO2 + H2O ↔ HCO3- + H+. Tämän proteiiniperheen tärkein tehtävä on säädellä happo-emästasapainoa, joka on biologisesti olennaisen tärkeä solujen ja kudosten toiminnassa. Lisäksi ne osallistuvat moniin muihin fysiologisiin toimintoihin, kuten CO2:n ja HCO3-:n kuljetukseen, luun resorptioon, biologisten nesteiden tuottamiseen, virtsantuotantoon, glukoneogeneesiin (glukoosin syntyyn) ja lipogeneesiin (rasvan syntyyn). CA:t ovat metalloentsyymejä, jotka sisältävät sinkkiatomin niiden aktiivisessa kohdassa, kun taas CARP:it eivät sido sinkkiä, koska niissä ei ole eräitä sinkin sitomiseen tarvittavia histidiini-aminohappoja.

Laajentuva CA geeniperhe sisältää 13 entsyymaattisesti aktiivista jäsentä, jotka eroavat rakenteeltaan ja katalyyttisiltä ominaisuuksiltaan. Aktiiviset isoentsyymit ja niiden sijainti soluissa on listattu alla olevassa taulukossa. Jokaisella isoformilla on luonteenomainen sijaintinsa kudoksissa.

Olemme aiemmin osoittaneet, että CA II, VII, IX ja XII ilmenevät monissa pahanlaatuisissa kasvaintyypeissä. Entsyymien sijainnin ja toiminnallisten tutkimusten perusteella voidaan arvella, että ne ovat osallisena syövän kasvuun liittyvissä prosesseissa, kuten solujen invaasiossa ja proliferaatiossa. Olemme myös osoittaneet, että CA IX entsyymin puute hiirellä johtaa mahalaukun epiteelin huomattavaan liikakasvuun. Hiljattain olemme myös tuottaneet uuden poistogeenisen (knock-out) hiirimallin CA VI puutokselle. CA VI on ainoa solujen ulkopuolelle eritettävä isoentsyymi ja se voi liittyä keskeisesti pH:n säätelyyn ylemmän ruoansulatuskanavan alueella.


Taulukko. Hiilihappoanhydraasit ja niiden sijainti soluissa

Hiilipitoinen
anhydraasi

Solujen alainen
sijainti

Erityispiirteet

I

solulimassa

 

II

solulimassa

 

III

solulimassa

 

IV

kalvosidonnainen

GPI ankkuri

VA

mitokondriossa

 

VB

mitokondriossa

 

VI

eritetty

 

VII

solulimassa

 

IX

kalvon lävistävä

proteoglykaanidomeini

XII

kalvon lävistävä

 

XIII

solulimassa

 

XIV

kalvon lävistävä

 

XV

kalvosidonnainen

GPI-ankkuri

 

VIDEO ESITTELY:

9. Kansainvälinen Hiilihappoanhydraasitutkimukseen liittyvä konferenssi pidettiin huhtikuussa 2012 Antalyassa, Turkissa. Professori Parkkila, Tampereen yliopiston Biolääketieteellisen teknologian- ja Lääketieteen yksiköistä, piti kokouksessa esitelmän aiheesta: "Role of CARPs: Novel information from zebrafish models." CARP-proteiinit ovat rakenteeltaan hiilihappoanhydraasien kaltaisia proteiineja, mutta niiltä puuttuu hiilihappoanhydraasien entsymaattinen aktiivisuus. Kokousesitelmässä kerrotaan CARP-proteiinien ilmentymisestä ja toiminnasta eri kudoksissa.

Video (Flash)

 


DeZnIT.jpg

Olemme mukana eurooppalaisessa DeZnIT tutkimuskonsortiumissa.

 
Biolääketieteellisen teknologian yksikkö
Biokatu 8
33520 Tampere, Finland
Ylläpito: webmaster@biomeditech.fi
Muutettu: 17.8.2012 10.05 Muokkaa

Tampereen yliopisto
03 355 111
kirjaamo@uta.fi

YLIOPISTO
Esittely
Opiskelijaksi
Opiskelu
Tutkimus
Yksiköt
Yhteystiedot

AJANKOHTAISTA
Avoimet työpaikat
Koulutusuudistus 2012
Rehtoriblogi
Tampereen yliopiston normaalikoulu
» lisää ajankohtaisia

PALVELUT
Avoin yliopisto
Hallinto
Kansainväliset asiat
Kielikeskus
Kielipalvelut
Kirjaamo
Kirjasto
Liikuntapalvelut
Viestintä
Tietohallinto
Tutkimuspalvelut
Täydennyskoulutus
Yhteiskuntatieteellinen tietoarkisto
» lisää palveluita

OPISKELU
Opetusohjelma
Opinto-oppaat
» lisää palveluita opiskelijalle

SÄHKÖISET PALVELUT
Intra
Moodle / TYT Moodle
Nelli
NettiOpsu / NettiRekka
NettiKatti
Sähköinen tenttipalvelu
Tamcat
Webmail
Wentti