Lääketieteen ja biotieteiden tiedekunnan graduohjeet

Bioteknologian tutkinto-ohjelma

Filosofian maisterin tutkintoon kuuluva kirjallinen pro gradu -tutkielma (40 op) perustuu ohjauksessa ja useimmiten tutkimusryhmässä tehtävään kokeelliseen tai laskennalliseen tutkimustyöhön. Tutkielma voidaan kirjoittaa äidinkielellä (suomi tai ruotsi) tai englanniksi.

Osaamistavoitteet
Opiskelija hallitsee tieteellisen ajattelun periaatteet ja tuntee tutkielman aihepiiriin tieteellisen taustan ja kysymyksenasettelut. Opiskelija kykenee tarvittavien tutkimusmenetelmien hallintaan sekä tieteelliseen viestintään omalla tieteenalallaan.

Sisältö
Tutkielma koostuu kirjallisuuskatsauksesta ja kokeellisesta tai laskennallisesta osasta. Tutkielmaan liittyvä kokeellinen/laskennallinen osa suoritetaan ohjauksessa yleensä tutkimusryhmässä osana laajempaa tutkimusprojektia. Opiskelijan itsenäinen osuus tutkielmasta on tällöin oltava erotettavissa.

Ohjeet
Tarkemmat ohjeet pro gradu -tutkielman suorittamiseen löytyvät opintojakson BTK4030 Thesis seminar Moodle-sivulta.

Lääketieteen lisensiaatin tutkinto-ohjelma

Lääketieteen tutkinto-ohjelman syventävät opinnot

Syventävät opinnot muodostuvat 20 opintopisteen laajuisesta opinnäytetyöstä ja 40 opintopisteen laajuisista integroiduista syventävistä opinnoista. Integroidut opinnot sisältyvät yleiseen opetus­suunnitelmaan. Syventävä opinnäytetyö sisältää tutkimussuunnitelman, työskentelyn tutkimusryhmässä tai itsenäi­sesti ohjaajan ohjauksessa, kirjallisen tutkielman ja kypsyysnäytteen.

Integroidut syventävät opinnot sisältyvät II–IV vuosikurssien integroituihin opintojaksoihin, IV–VI:n vuoden kliinisiin opintoihin sekä opinnot päättävään Valmistuminen -jaksoon. Jaksojen integroidut semi­naarit ja opiskelijoiden suorittamat vaativat tehtävät katsotaan jaksoissa lääketieteen syventäviksi opinnoiksi.

Syventävien opintojen opinnäytetyön tavoitteena on kehittää opiskelijan valmiutta itsenäiseen, kriittiseen ja tieteellisesti perusteltuun ratkaisujen tekoon, tieteellisen tiedon luomiseen ja hyväksikäyttöön sekä tulosten suulliseen ja kirjalliseen ilmaisemiseen.

Syventävien opintojen tutkielma on yliopistollinen opinnäyte, jonka tekemisessä opiskelijan tulee noudattaa hyvää tieteellistä käytäntöä sekä opiskelun ja tutkimuksen eettisiä periaatteita opetussuunnitelmassa kuvattujen osaamistavoitteiden pohjalta.

Jättäessään opinnäytteensä tarkastettavaksi, opiskelijan edellytetään tuntevan ja noudattavan oman tutkintonsa tason mukaiset hyvät tieteelliset käytännöt, ks. Tampereen yliopiston tutkijakoulun antamat ohjeet hyvän tieteellisen käytännön osaamistavoitteista eri tutkintotasoilla.

Hyvän tieteellisen käytännön varmistamiseksi jokainen syventävien opintojen opinnäytetyö tarkistetaan Turnitin-plagiaatintunnistusjärjestelmän avulla ennen tutkielman arvostelua. Turnitin -alusta voidaan ottaa käyttöön jo opinnäytetyön suunnitelman hyväksymisvaiheessa.  Ohjaaja liittää opiskelijan Turnitin -plagiaatintunnistusjärjestemän Moodle alueelle.

Opinnäytteen tiivistelmän alareunaan on hyvä lisätä teksti: Tämän opinnäytteen alkuperäisyys on tarkastettu Turnitin OriginalityCheck-ohjelmalla Tampereen yliopiston laatujärjestelmän mukaisesti.

Lisätietoja:

Missä opintojen vaiheessa syventävän opinnäytetyön tekeminen tulisi aloittaa?

Opinnäytetyön voi aloittaa projektista riippuen opiskelun eri vaiheissa. Tutkimussuunnitelma on hyvä rekisteröidä mahdollisimman varhaisessa opintojen vaiheessa. Rekisteröinti on kuitenkin tehtävä viimeistään CV-syyslukukauden loppuun mennessä.

    1. Opinnäytetyötä koskevat yleismääräykset löytyvät yleisistä säädöksistä .

      Aloittaessasi syventävien opintojen opinnäytetyön tekemistä, ota yhteyttä siihen tutkimusryhmään tai oppialaan, joka sinua kiinnostaa.
      Tietoja muista tutkimusryhmistä löytyy mm. seuraavilta sivustoilta:
      Pirkanmaan sairaanhoitopiirin yhteydessä toimivat tutkimusryhmät
      Terveystieteiden tutkimusryhmät
      Biotieteiden tutkimusryhmät
      UKK-instituutti

      Opinnäytetyön aiheen, sekä vastuuohjaajan tulee olla lääketieteen, terveystieteiden tai näihin läheisesti liittyvällä tieteenalalla, kuten esimerkiksi lääketieteellisen bioteknologian alalla, toimiva professori, dosentti tai tohtorin tutkinnon suorittanut, opinnäytetyön aiheen asiantuntija. Edellä mainittujen lisäksi toisena ohjaajana voi toimia vastuuohjaajan suosittelema, ylemmän korkeakoulututkinnon suorittanut alan asiantuntija.
       
    2. Kun olet löytänyt ohjaajan, laadi tutkimussuunnitelma ja hyväksytä se vastuuohjaajallasi. Pyydä vastuuohjaajalta ehdotus opinnäytetyösi toiseksi tarkastajaksi, täytä, tulosta ja allekirjoita vastuuohjaajan kanssa opinnäytetyön rekisteröintilomake / ohjaussopimus ja toimita täyttämänne ja allekirjoittamanne lomake, sekä tutkimussuunnitelmasi opinnäytetyöasioita hoitavalle opetuskoordinaattorille. Lähetä tutkimussuunnitelmasi myös tiedoksi sen oppialan professorille, jonka oppialalla opinnäytetyösi vastuuohjaaja toimii.

      Jo opinnäytteen tutkimussuunnitelmaa laatiessasi sinun on hyvä huomioida, että opinnäyte on julkinen asiakirja heti, kun opinnäyte on hyväksytty. Opinnäytteeseen ei siten saa sisällyttää salassapidettävää materiaalia vaan mahdollinen salassapidettävä materiaali on jätettävä opinnäytteen tausta-aineistoon.
    3. Työskentely tutkimusryhmässä / ohjaajan johdolla - tutkimuksen tekeminen ja kirjallisen opinnäytetyön kirjoittaminen

      Opinnäytetyön suorittamisen vaihtoehtoja ovat:

      Kokeellisen, kliinisen tai muun empiirisen tutkimustyön tekeminen ja raportin kirjoittaminen tutkimustyöstä. Raporttiin tulee sisällyttää kirjallisuuskatsaus osaksi johdantolukua (min. noin 3 sivua) ja pohdintalukua (min. noin 2-3 sivua) tai omaksi pääluvukseen (min. noin 5 sivua).

      Tai

      referee-käytännön mukaisessa tieteellisessä julkaisusarjassa julkaistu tai tieteelliseen julkaisusarjaan julkaistavaksi lähetetty alkuperäisartikkeli sekä opiskelijan itsenäisesti laatima suomenkielinen tiivistelmä. Jos opiskelija ei ole artikkelin ensimmäinen kirjoittaja, hän laatii lisäksi itsenäisesti kirjallisuuskatsauksen (5-10 sivua, suomeksi tai artikkelin kielellä).

      Tai

      laaja, systemaattinen, review-tyyppinen kirjallisuuskatsaus.

      Jos tutkimuksesta on suunnitteilla artikkeli tai artikkelia ei jostain syystä vielä haluta lähettää lehteen, opinnäytetyö tulee kirjoittaa ensimmäisen vaihtoehdon mukaiseen raporttimuotoon.

      Lisäksi opinnäytetyön suorittamiseen kuuluu mahdollisesti ohjaajan kanssa sovittavia metodologisia opintoja.

      Opinnäytetyölle ei ole asetettu sivumäärärajoja, koska erilaiset kokeelliset tai kliiniset tutkimukset vaativat erilaista työmäärää ja erilaiset aiheet erilaista käsittelytapaa. Raporttimuotoinen opinnäytetyö on tavallisesti 20–40 sivun mittainen. Laaja, systemaattinen, review-tyyppinen kirjallisuuskatsaus on sen sijaan on yleensä hieman pidempi.

      Opinnäytetöiden kieliasua ei yliopiston puolesta tarkisteta, joten kiinnitäthän erityistä huomiota opinnäytteesi kieliasun oikeellisuuteen ja ulkoasun asianmukaisuuteen. Suomen kielen opettaja on laatinut oheiset opinnäytteen kirjoitusohjeet (.pdf), hyödynnäthän niitä työsi kieli- ja ulkoasun muotoilussa ja tarkistuksessa. Jos työsi on englanninkielinen, noudata ohjeita työn rakenteen ja ulkoasun osalta. Jos työsi on referee-käytännön mukaiseen tieteelliseen lehteen lähetetty artikkeli, noudata kieli- ja ulkoasuohjeita, kun teet työllesi nimiölehden, tiivistelmän, kirjallisuuskatsauksen sisällysluetteloineen ja muotoilet artikkelin ulkoasua opinnäytetyön liitteeksi sopivaksi.
    4. Täytä tutkielman hyväksymislomake omalta osaltasi ja tuo lomake sen jälkeen opetuskoordinaattorille. Kun tiedekuntasi dekaani on hyväksynyt opinnäytetyösi tarkastajat, toimita opinnäytetyösi sekä hyväksymislomake ohjaajalle ja toiselle tarkastajalle opinnäytetyön tarkastusta varten.
    5. Tee opinnäytteeseesi tarkastajien ehdottamat korjaukset ja viimeistele työsi vielä kerran myös kieli- ja ulkoasun osalta (ohjeet). Opinnäytteitä ei lähetetä kielentarkastajalle, joten muistathan viimeistellä ja tarkistaa huolellisesti työsi kieli- ja ulkoasun. Tallenna lopullinen versio ohjaajasi Turnitin -plagiaatintunnistusjärjestelmän Moodle -alueelle, jotta ohjaaja voi tehdä Turnitin-ajon.
    6. Toimita tarkastajien allekirjoittama hyväksymislomake opinnäytetyöasioita hoitavalle opetuskoordinaattorille. Jos työsi on artikkelimuotoinen, tarvitaan myös tosite (esim. sähköpostivastaus) artikkelin saapumisesta lehteen. Jos et ole artikkelin ensimmäinen kirjoittaja, hyväksymistä varten tarvitaan lisäksi ohjaajasi lausunto, jossa hän vahvistaa osuutesi työn eri vaiheissa.

      Mikäli ohjaajasi työskentelee terveystieteiden tai biotieteiden alla, hoidathan työsi hyväksyttämiseen liittyvät asiat asianomaisen henkilön kanssa. Terveystieteiden opinnäyteasioita hallinnoi opintosihteeri Nina Ekdahl ja biotieteiden asioita opintokoordinaattori Riitta Aallos.
    7. Kun Turnitin-ajo on tehty / hyväksytty, tallenna opinnäytetyösi NettiOpsuun. NettiOpsusta opinnäyte menee yliopistopainoon painettavaksi ja kirjastoon verkkojulkaisemista varten. Tarkemmat ohjeet NettiOpsuun tallentamisesta ja verkkojulkaisuluvan antamisesta jäljempänä.
    8. Kypsyysnäytteen suorittaminen. Lääketieteen ja biotieteiden tiedekunnassa kypsyysnäyte kirjoitetaan sähköisenä tenttinä. Opiskelijan syventävän työn vastuuohjaaja toimittaa sähköpostilla 3 kypsyysnäytekysymystä opinnäytetöistä vastaavalle opetuskoordinaattorille. (Kypsyysnäyte kirjoitetaan sitten, kun työ on jätetty tarkastettavaksi, mutta otathan kypsyysnäytteeseen liittyvissä asioissa hyvissä ajoin yhteyttä opetuskoordinaattoriin.) Lisätietoa (esim. ohjeita ja opastevideoita) sähköisestä tenttimisestä löydät tenttiksen eli sähköisen tenttipalvelun sivuilta. Ohjaaja tarkistaa kypsyysnäytteen asiasisällön ja suomen kielen tarkastaja kieliasun. Tampereen yliopiston ohjeet kypsyysnäytteen kirjoittajalle
    9. Kun kypsyysnäyte on hyväksytty sekä asiasisällön, että kieliasun osalta ja opinnäytetyö on ladattu NettiOpsuun, opinnäytetyö menee tiedekunnan dekaanille hyväksyttäväksi, hyväksynnän jälkeen opinnäytetyön suoritusmerkintä kirjataan opintosuoritusrekisteriin.
    10. On suositeltavaa ja toivottavaa, että opinnäytteesi suoritusmerkinnän saatuasi lähetät opinnäytteesi tiivistelmän Duodecim-lehden "Kandin kulmaan".

Lääketieteen syventävien opintojen opinnäytteen verkkojulkaiseminen

(Lue ensin ensin suomen kielen opettajan laatimat ohjeet opinnäytteen kieli- ja ulkoasua varten ja viimeistele opinnäytteesi huolellisesti)

Menettelyllä pyritään nopeuttamaan ja yksinkertaistamaan syventäviin opintoihin kuuluvan opinnäytteen julkaisu- ja arkistointiprosessia. Tarkoituksena on saada enemmän opinnäytteitä verkkoon kirjaston ylläpitämään TamPub-julkaisuarkistoon ja toisaalta varmistaa opinnäytteen asianmukaisen arkistokappaleen valmistus.

Tietoa ja ohjeita verkkojulkaisusta:

Kun opinnäytetyösi on "perinteinen" tutkimusraportti tai laaja kirjallisuuskatsaus:

  1. Kun opinnäytteesi on hyväksytty sekä tarvittavat korjaukset tehty, tallenna opinnnäytteesi ja sitä koskevat tiedot NettiOpsuun. Tallenna opinnäytteesi yhtenä tiedostona pdf-muotoon omalla nimelläsi (Virtanen_gradu.pdf). Kopioi NettiOpsuun myös opinnäytteesi tiivistelmä, se poimitaan tästä tietokantaan ja julkaistaan opinnäytteesi tietojen yhteydessä. Mikäli et halua, että tiivistelmä näkyy verkossa, älä kopio sitä NettiOpsuun. Tiivistelmän täytyy kuitenkin ehdottomasti sisältyä opinnäytteesi pdf-tiedostoon.
  2. Julkaisulupa: Lue huolellisesti julkaisulupaa koskeva osuus. Varmista, että sinulla on tekijänoikeus opinnäytetyöhösi sisältyviin kuviin, taulukoihin tai muuhun aineistoon, tai että olet hankkinut verkkojulkaisuluvan tällaiseen aineistoon.   Anna lupa julkaista opinnäytteesi verkossa tai valitse "en anna", jos haluat kieltää luvan. Verkkojulkaisuluvan antaminen merkitsee, että kirjasto maksaa yhden opinnäytetyön painatuskulut ( kirjaston kappale, mustavalkoinen painatus), jonka muutoin joudut itse maksamaan. NettiOpsussa voit myös tilata maksullisia kappaleita omaan käyttöösi.
  3. Verkkojulkaisu ja arkistointi: NettiOpsusta tulee sähköpostilla tiedekunnalle tieto, että olet ladannut työsi ja yliopistopainosta painettu kappale menee kirjastoon kirjaston kokoelmiin ja tulevaa arkistointia varten. Kirjasto julkaisee opinnäytteesi ja sen tiivistelmän verkossa , jos olet antanut verkkojulkaisuluvan. Opinnäyte julkaistaan sen jälkeen, kun tieto opinnäytteen hyväksymisestä on siirtynyt opiskelijatietojärjestelmästä kirjastoon. Kirjasto luetteloi opinnäytteen sähköisen ja paperiversion kirjaston Tamcat-tietokantaan ja liittää opinnäytekokoelmaan Yliopistopainosta saapuneen opinnäytteen. Opinnäyte säilytetään kirjastossa pysyvästi.

Kun opinnäytetyösi on artikkelimuotoinen:

Artikkelimuotoiset opinnäytteet tallennetaan NettiOpsuun ja painatetaan, kuten kaikki muutkin opinnäytteet. Opinnäytteelle on hyvä antaa eri nimeke kuin aiotulle artikkelille, jotta valmis opinnäyte voidaan luetteloida kirjastotietokantaan nimellään vaikka artikkeli olisi vielä julkaisuprosessissa.

  1. Mikäli artikkeli on pre print –vaiheessa, tallenna NettiOpsuun opinnäytetyösi nimiölehti, suomenkielinen tiivistelmä, sisällysluettelo, artikkelin aihepiiristä laatimasi kirjallisuuskatsaus sekä liitteenä lehteen lähetetty artikkeli, jonka ulkoasua hieman muotoilet opinnäytteeseesi sopivaksi. Tallenna koko edellä mainittu työ Netti-Opsuun yhtenäisenä pdf-tiedostona ja tallenna lisäksi NettiOpsuun erikseen opinnäytteesi tiivistelmä, joka julkaistaan yliopiston tutkielmatietokannassa. Mikäli et halua, että tiivistelmä näkyy verkossa, älä kopio sitä NettiOpsuun. Tiivistelmän täytyy kuitenkin ehdottomasti sisältyä opinnäytteesi pdf-tiedostoon.

    Voit lehden ja kanssakirjoittajien luvalla antaa opinnäytteeseesi sisältyvän artikkelin pre print –versioon verkkojulkaisuluvan, jolloin koko työ julkaistaan tutkielmatietokannassa. Tarkista lehden lupa SHERPA/RoMEO –palvelusta

    Yliopiston kirjastolta saa tarvittaessa apua SHERPA/RoMEO:n tulkinnassa. Mikäli tiedot eivät SHERPA/RoMEO:sta löydy, tarkista julkaisulupa suoraan lehden julkaisijalta. Kaikki lehdet eivät salli artikkeleiden julkaisemista avoimessa verkossa.
  2. Mikäli lehteen lähetetty artikkeli on jo post-print eli accepted -vaiheessa, tallenna opinnäytteesi NettiOpsuun samalla tavalla kuin pre print –vaiheessakin oleva artikkeli tallennetaan. Selvitä, saako artikkelin julkaista yliopiston julkaisutietokannassa. Tarkista lupa SHERPA/RoMEO –palvelusta
    Yliopiston kirjastolta saa tarvittaessa apua SHERPA/RoMEO:sta löytyvien tietojen tulkinnassa. Jos tiedot eivät SHERPA/RoMEO:sta löydy, voit tarkistaa julkaisuluvan suoraan lehden julkaisijalta. Mikäli on epäselvää, pyydetäänkö lupaa kustantajalta vai lehdeltä, tarkista asia copyright-asiakirjasta. Kustantajilla on rinnakkaisjulkaisuluvan hakemista varten usein olemassa verkkolomake tai lupaa tulee hakea Copyright clearance center –palvelusta.
  3. Mikäli lehti asettaa artikkelin julkaisemiselle embargon, mainitse asiasta tallentaessasi opinnäytteesi NettiOpsuun, jolloin kirjasto vapauttaa opinnäytteesi tutkielmatietokantaan vasta embargo-ajan päättyttyä. Embargo kestää yleisimmin puolesta vuodesta vuoteen. Tarkista mahdollinen embargo ja siihen liittyvät ehdot SHERPA/RoMEO:sta tai tiedustele asiaa lehdeltä/kustantajalta. Selvitä embargon mahdollisuus siis silloinkin, kun tallennat opinnäytteesi NettiOpsuun ns. pre-print –vaiheessa, jolloin lehden kanssa ei vielä ole tehty julkaisusopimusta.


    Kustantaja saattaa tarjota tekijälle/tekijöille sopimusta, jolla kaikki oikeudet siirtyvät kustantajalle, mutta tällaisen sopimuksen allekirjoittamista on syytä välttää. Yliopistossa toimivia tutkijoita kehotetaankin pidättämään itsellään oikeus rinnakkaistallentaa artikkelinsa yliopiston tutkielmatietokantaan/julkaisuarkistoon.

    Lisätietoja artikkeleiden eri versioista löytyy rinnakkaistallennussivulta.

Lisätiedot ja kirjaston yksityiskohtaiset ohjeet verkkojulkaisemista:

Ohjeet opinnäytetietojen ja opinnäytteen tallentamisesta NettiOpsuun

PDF-ohje opinnäytteen tallentamiseksi pdf:ksi

Painotyöhön liittyvät asiat: Yliopistopaino Juvenes Print, gradupaino(at)uta.fi, puh. 020 756 8683. Verkkojulkaisemiseen liittyvät asiat (Eila Kiuru / Kirjasto), tutkielmat(at)uta.fi

Julkaisulupaan, SHERPA/RoMEO:n tulkintaan ja rinnakkaistallentamiseen liittyvät asiat: Raila Melin / Tertio, puh. 040 190 4238, oa(at)uta.fi

Materiaalit ja linkit

Suomen kielen ohjeita: Duodecim-lehden kirjoitusohjeet

Nykyajan kielenopas

Tampereen yliopisto, Kielikeskus. Suomen kielen kielenhuoltosivusto

Kirjoittajan ABC-kortti

Kotimaisten kielten tutkimuskeskus. Kielitoimiston ohjeita ja suosituksia. Materiaalia ja testejä mm. lyhenteistä ja pilkun käytöstä.